消毒的劑量

消毒劑量是殺滅微生物的基本條件，它包括消毒強度和時間兩方面。消毒強度在熱力消毒時是指溫度高低；在化學消毒時是指物濃度；在紫外線消毒時是指紫外線照射強度。一般來說，增加消毒處理強度能相應提高消毒（殺菌）的速度；而減少消毒作用時間也使消毒效果降低。當然，如果消毒強度降低至一定程度，即使再延長時間也達不到消毒目的。

微生物污染的種類和數量

生物的種類不同，對其消毒的效果自然不同。另外微生物的數量的多少也會影響消毒效果，所以在消毒前要考慮到微生物污染的種類和數量。一般來說，微生物的抵抗力越強、污染越嚴重、消毒就越困難。

溫度的影響

除熱力消毒完全依靠溫度作用來殺滅微生物外，其他各種消毒方法亦都受溫度變化的影響。一般來說，無論在物理消毒還是化消毒劑中，溫度越高效果越好。關于溫度變化對消毒效果的影響的程度，往往隨消毒方法、藥物及微生物種類不同而異，一般可溫度系數來表示。
相對溫度 消毒環境相對濕度對氣體消毒和熏蒸消毒的影響的影響十分明顯，溫度過高或過低都會影響消毒效果，甚至導致消毒失敗。室內空氣甲醛熏蒸消毒的相對濕度應為80-90%，小型環氧乙烷消毒處理的相對濕度以40-60%為宜大型消毒（>0.15立方米）為 50%-80%。另外紫外線在相對濕度為60%以下殺菌力較強，在80%-90% 時殺菌力下降30%-40%，因為相對濕度增高回影響紫外線的穿透力。

酸堿度（PH值）

酸堿度的變化可直接影響某些消毒方法的效果。一方面是PH值對消毒劑本身的影響會降低或提高消毒劑的活性；另一方面是PH值對微生物的影響。如戊二醛在PH值由3升至8時，殺菌作用逐步增強；而次氯酸鹽溶液PH值由3升至8時，殺菌作用卻逐漸下降；洗必泰、季銨鹽類化合物在堿性環境中殺菌作用較大。